Docente

Prof. Serena Varotto serena.varotto@unipd.it

Crediti

5 CFU

Attività formativa prevista

Lezione (h):42

Esercitazioni (h):8

Seminari (h):

Totale ore*50:

Ore di studio individuale previste:

Finalità

A) lo studente apprende le conoscenze  di base della genomica, struttura, composizione e caratteristiche dei genomi, con particolare riferimento al genoma della vite e alle peculiarità che lo caratterizzano. B) Le conoscenze potranno essere applicate nell’ambito della tipizzazione varieatale, della conservazione delle risorse e del miglioramento genetico della vite.

Programma

Il corso prevede una parte iniziale dedicata alle tecniche avanzate di analisi genomica come premessa al programma di studio che comprende i seguenti argomenti:  introduzione alla genomica: dai geni ai genomi e viceversa. Dalle librerie genomiche al sequenziamento dei genomi. Struttura del genoma: genoma codificante e genoma non codificante. Genomi ed epigenomi . La costruzione delle mappe nell’analisi dei genomi. Utilizzo delle mappe geniche. Genomica comparativa. Genomica funzionale. Trascrittomica e cenni di proteomica. Caratteristiche del genoma della vite. Il genoma organellare dei vegetali e della vite. Fingerprinting varietale. Approfondimento sulla genomica della vite: genomica trascrittomica e proteomica stato dell’arte.

Contents

The course will be run for the first hours describing the current techniques of genomic analyses. Genomics: definition and tasks. Genomics integrates five traditional areas of genetics: Mendelian genetics, cytogenetic, molecular genetics, quantitative genetics and population’s genetics.

Genetic maps. Cytogenetic maps. Physical maps. Comparative genomics.

Genome sequencing and bioinformatics tools.

Structural genomics and epigenomics. Functional genomics (trascriptomic and proteomic tools).

Sequencing of mitochondrial and chloroplast genomes.

Sequencing of grapevine genome: characteristics and peculiarities of the grape genome.

Bibliografia

Per il materiale ausiliario contattare il Professore

Modalità d'esame

Esame orale.

Orario di ricevimento

Al termine delle lezioni durante il corso e per appuntamento ad Agripolis-DAFNAE